从头开始合成细胞:中国科学院携手亚洲百余课题组公布十年路线图

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在合成细胞学的王座之上,有一枚所有学者都希冀的明珠——从头构建一个完全人工合成的活细胞,把一个被磷脂包裹的系统,从底层做成能够自主表达基因、维持代谢、复制基因组、持续生长并完成分裂的「人工生命雏形」。

几十年来,尽管人类在基因合成和单模块构建上取得了长足进步,却始终卡在一个致命的瓶颈上:如何让无数个核心功能模块,在时间和空间上达成完美的非线性协同。

为了打破这一僵局,由中国科学院领衔,汇聚了中国、日本、韩国、新加坡、泰国、马来西亚等国家的 100 多个顶尖研究团队的 SynCell Asia Initiative(亚洲合成细胞倡议),在《Nature Biotechnology》上正式发表了高赞评论文章「A framework for building a synthetic cell from the SynCell Asia Initiative」,首次向全球公布了其雄心勃勃的十年战略路线图。

论文链接:https://www.nature.com/articles/s41587-026-03153-w

四大物理与工程学高墙

把一堆蛋白质、DNA 和脂质丢进试管中,它们并不会自动变成生命。目前 SynCell Asia 路线图清醒地指出了当前横亘在人类面前的四座大山:

  1. 代谢断流 🔋:目前的无细胞系统(Cell-free systems)本质上是「吃老本」。它们依赖人类预先加进去的 ATP、NADH 等能量底物,要不了多久就会消耗殆尽,导致系统陷入死亡平衡。人造细胞必须学会自己利用初级原料,进行基因主导的能量再生。

  2. 核糖体瘫痪 🏗️:核糖体是蛋白质的工厂。在活细胞里,它的组装需要大量伴侣蛋白、RNA修饰和空间 compartmentalization 的精准配合。人工合成系统缺乏这些机制,导致合成出来的核糖体大都是「残次品」,无法自主循环再生,蛋白质合成很快就会戛然而止。

  3. 生物物理耦合 📐:我们知道细胞膜扩大需要脂质合成和渗透压,但怎么让新合成的脂质完美精准地补充到外层膜上,并与细胞体积的增大同步?细胞分裂需要膜弯曲和隔膜闭合,如何实现完美的拓扑学分裂?这些基础物理规则至今仍是未解之谜。

  4. 时空失控的细胞周期 ⏳:DNA 复制、染色体隔离、细胞分裂,这三者在时间与空间上必须严丝合缝地同步。当前的人造环境缺乏这种高维度的多层次动态调节,经常导致 DNA 乱复制一通,而细胞却根本无法分裂。

图示:即将开放使用的 SynCell Asia 官网。

相关链接:https://syncellasia.org/

分两个阶段走

为了把这条路从「愿景」变成「工程计划」,SynCell Asia 设计了两阶段路线。

阶段 1 的目标是并行发展四个核心功能模块:代谢、基因组复制与分离、分裂机器、膜系统。随后把这些模块整合进一个 ProtoCell。该设计旨在实现模块制备与表征的自动化,从而加快模块级别的设计-构建-测试-学习(DBTL)循环,优化原细胞的组合模块组装流程。

• 囊泡稳定:尺寸在 1-50 μm 的磷脂囊泡,结构稳定维持 >7 天。

• 信息遗传:≥200 个基因的最小基因组,单分子复制错误率控制在每 10^6 个碱基对中只有 1~5 个错误。

• 基因表达:要能通过体外转录翻译覆盖 ≥90% 的关键蛋白和 RNA 组分。

• 代谢功能:关键代谢物的内部合成,通过工程化膜蛋白的受控运输实现营养物质内流与代谢废物外排。

…………

图示:使用智能细胞模拟原细胞的合成组织工程。

相关链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0142961221002970

阶段 2 的目标是把 ProtoCell 推向 AutoCell,也就是创造一个能够持续自我维护、自动复制、定向进化并出现集体行为的系统。

这个阶段的关键,是把外源系统逐步替换为内生、基因组编码的机器,最典型的就是引入 自我再生核糖体,让表达系统本身成为可复制的内部模块。

该阶段的目标也十分明确:要实现 超过 10 个连续、协调的生长—分裂周期,且细胞大小分布的变异系数 小于 15%;同时还要支持定向进化,让代谢和形态在选择压力下持续优化。

AI 驱动的循环

分布式、独立实验的模式之所以失败,是因为合成细胞的各种分子信号转瞬即逝,且不同实验室的标准根本无法统一。为此,SynCell Asia 创新性地提出了 「中央工厂 + 分布式工作站」 的硬件架构。

统一的生物底盘、标准化协议、在线协调系统和资源分配机制,会让大规模数据的获取变得可能,而这些数据又将反过来用于训练预测模型和构建完善的进化库。

此外,文章还提出要发展 single-syncell omics,在单个 synthetic cell 分辨率下同步获取基因组、转录组、蛋白组和代谢组数据,再结合形态和功能成像,把「分子组成—细胞行为」之间的因果联系系统地映射出来。

多方协作发展

合成细胞是一个需要物理学、计算机科学、工程学、伦理学和社会科学共同推进的长期任务。文章呼吁多方重构资助机制、建立跨学科会议和开放工具链,把成功指标从单一论文变成共享平台、联合 benchmark 和多站点复现。

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